最佳参考电平的取值要使得最小的仪器失真(使输入讯号饱和的非常低的参考电平导致)和最小的噪音基底(参考电平过高，减少了仪器的灵敏度和动态范围而导致)取得平衡。有时候，设置一个低参考电平对于宽带噪音测量是有好处的，尽管产生一些仪器失真。当能够认可失真时，这样做会改善仪器的灵敏度，并保证在测量中将其排除在外。 

衰减器设置控制也决定仪器的输入范围。该设置通常被设置到自动模式，软件根据参考电平来调整衰减器的值。 

在韧体中，频谱分析仪将显示器的Y轴与参考电平或衰减器联动在一起。虚拟仪器则没有限制，如果需要时，显示器的Y轴可以与这些控制脱离。该功能可以实现频谱的可视化缩放，而不影响仪器的幅度设置。注意，参考电平和衰减器设置都影响可程序衰减器，故只需设置其中的一个即可。 

检测模式是另一种幅度控制方式，适用于传统的扫描频谱分析仪，但不能用于基于FFT的分析仪。可分为普通、峰值、采样或负峰值等模式，具体检测模式决定了频谱分析仪如何减少频谱信息，或者说如何压缩频谱信息。 

另外它还影响总功率测量。当频谱数据点超过频谱分析仪所能显示的点数时，分析仪将从数据减少策略中获益。这将使检测模式改变功率测量。 

图1：频谱分析仪测量结果的频率和幅度关系

影响精密度的因素 

频谱分析仪采用起始和终止频率之间的频率扫描。一个模拟斜坡讯号产生该频率扫描讯号，而起始频率由来自高精密度的时间基准讯号合成。于是，测量精密度由模拟斜坡讯号和IF滤波器的中心频率所决定。 

基于FFT的分析仪，没有这样的模拟斜坡讯号，故没有这些因素的限制，因而在整个测量范围内具有一致的精密度。范围内的精密度则取决于时基和测量算法，故可以比较容易地获得频率精密度和重复性。 

在传统型扫描分析仪中，频率误差的原因包括基准频率误差，频率范围精密度(范围的5%)和RBW(RBW的15%)。相应地，在基于FFT的分析仪中的频率误差则包括基准频率误差和RBW，具体取决于测量算法，变化范围为RBW的>50%到<10%之间。